后疫情时代,分子诊断成为实验人员熟知的一项技术,而Taq DNA聚合酶、逆转录酶、UDG酶等是分子诊断技术中最重要的原料,以上分子酶原料的质量直接影响到分子诊断技术的准确度、灵敏度和特异性,因此筛选出一套优异的分子酶显得尤为重要。商业化分子酶主要采用工程菌株(如大肠杆菌等)进行重组表达,因此分子酶中会存在一定量的宿主基因组DNA残留,加上制备环境和人源等因素影响,分子酶制品中极易存在污染DNA。在病原体检测过程中,污染的DNA可能会淹没低丰度的靶标核酸,或与靶标核酸一起被检出,从而影响靶标检出灵敏度或造成假阳性结果,给医生诊断和用药造成困扰。
另一方面,随着生物制品的市场占比越来越大,相关部门也建立起规范的质量管理体系和标准来把关生物制品质量,其中宿主细胞核酸残留问题是备受关注的焦点之一。生物制品如重组蛋白药、抗体药、疫苗等产品是用连续传代的菌种株/细胞株表达的,产品内可能会残存宿主核酸。残留的宿主细胞核酸可能引发细胞因增殖失控变为肿瘤细胞,也有可能存在感染性病毒基因从而加剧体内免疫反应。为了规避上述不良后果,从生物制品安全角度和科研需求的层面,进行有效的核酸残留去除与严格的残留检测非常重要,行业内已广泛应用qPCR方法开发用于检测生物制品中的宿主核酸残留检测试剂盒。在宿主核酸残留质控产品开发过程中,分子酶原料中若存在残留宿主(如人源、鼠源、大肠杆菌、酵母等)核酸,极可能造成质控产品定量不准确,从而给生产的生物制品带来安全隐患。
翌圣UCF.ME®
超低残留分子酶解决方案
为解决病原检测背景菌及宿主核酸残留干扰问题,翌圣已建立完善的UCF.ME®超低残留分子酶研发、生产平台,通过物料、环境、工艺、过程、质量等多环节把控,目前已实现多种UCF.ME®超低残留分子酶的规模化生产。
(点击可查看大图)
图1 翌圣UCF.ME®超洁净分子酶生产基地
翌圣UCF.ME®
超低残留分子酶产品
翌圣通过ZymeEditor™酶改造平台对qPCR检测、NGS建库全套分子酶进行改造,同时使用UCF.ME®超低残留工艺对分子酶产品进行处理,目前可规模化提供用于qPCR检测,NGS建库的全套高性能、超低宿主残留的分子酶原料,助力解决病原检测及宿主核酸残留质控产品中的宿主及背景菌核酸干扰,提高检测准确度。
表1 翌圣UCF.ME®超低残留分子酶产品清单
部分数据展示(以UCF.ME® Hotstart Sensitive Taq DNA Polymerase 为例 )
E. coli基因组DNA残留
<0.005 copies/U
使用E.coli宿主细胞DNA残留检测试剂盒(线性范围30 fg/μL-300 pg/μL),检测三批次超低残留热启动Taq酶,结果显示三批次Taq酶的E. coli基因组DNA残留均<0.005 copies/ U。
图2:翌圣UCF.ME® Taq酶(Cat#14314ES)E.coli基因组DNA残留检测
质粒DNA残留无检出,优于进口品牌
使用翌圣UCF.ME® Taq酶(Cat#14314ES)及进口品牌A的Taq DNA聚合酶进行质粒DNA残留检测,结果显示,进口品牌A的Taq DNA聚合酶中存在质粒DNA残留,翌圣UCF.ME® Taq酶( Cat#14314ES )中无质粒DNA检出。
图3 质粒DNA残留检测结果
11种常见背景菌无检出
使用翌圣UCF.ME® Taq酶(Cat#14314ES)搭配铜绿假单胞菌,鲍曼不动杆菌,粘质沙雷氏菌,肺炎克雷伯菌,嗜麦芽窄食单胞菌,肺炎链球菌,屎肠球菌,金黄色葡萄球菌,大肠杆菌,粪肠球菌,白色念珠菌特异性引探对NTC(No Template Control)进行检测,结果显示,翌圣UCF.ME® Taq酶( Cat# 14314ES )中无以上11种常见背景菌检出。
图4 11种常见背景菌检测结果(限于篇幅,以铜绿假单胞菌,鲍曼不动杆菌,粘质沙雷氏菌,肺炎克雷伯菌为例进行展示)
客户测试案例展示
客户分别使用市售常规Taq酶和翌圣UCF.ME® Taq酶(Cat#14314ES)搭配客户E. coli特异性引探对NTC进行检测,结果显示市售常规Taq酶在22次重复实验中出现5次起峰,而翌圣UCF.ME® Taq酶(Cat#14314ES)在22次重复实验中均未起峰,结果表明翌圣UCF.ME® Taq酶(Cat#14314ES)未检出E. coli基因组DNA。
图5:E.coli 基因组DNA残留检测(客户测试案例)
左图:市售常规Taq酶;右图:翌圣UCF.ME® Taq酶(Cat#14314ES)
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来源:CACLP体外诊断资讯
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